Home
Search 
Browse 
Download
ManualDetails of Host Protein
| Host Protein General Information (ID: PT0683) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Protein Name |
82 kDa FMRP-interacting protein (82-FIP)
|
Gene Name |
NUFIP2
|
||||||
| Host Species |
Homo sapiens
|
Uniprot Entry Name |
NUFP2_HUMAN
|
||||||
| Subcellular Location |
Nucleus; Cytoplasm; Stress granule
|
||||||||
| External Link | |||||||||
| NCBI Gene ID | |||||||||
| Uniprot ID | |||||||||
| Ensembl ID | |||||||||
| HGNC ID | |||||||||
| Function in Host |
Binds RNA.
[1]
Click to Show/Hide
|
||||||||
| 3D Structure |
|
||||||||
| Function of This Protein During Virus Infection | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Virus Name | SARS-COV-2 | Protein Function | Pro-viral | [2] | |||||
| Infected Tissue | Lung | Infection Time | 48 h | ||||||
| Infected Cell | Calu-3 cells (Human lung cancer cell line) | Cellosaurus ID | CVCL_0609 | ||||||
| Method Description | To detect the role of host protein NUFIP2 in viral infection, NUFIP2 protein knockout Calu-3 cells were infected with SARS-COV-2 for 48 h , and the effects on infection was detected through qRT-PCR. | ||||||||
| Results | It is reported that Knockdown of NUFIP2 leads to the reduced SARS-CoV-2 RNA levels compared with control group. | ||||||||
| Full List of Virus RNA Interacting with This Protien | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RNA Region: Not Specified Virus Region (hCoV-19/France/IDF-220-95/2020 ) | |||||||||
| RNA Region Details |
RNA Info
Click to show the detail information of this RNA binding region
|
[3] | |||||||
| Strains Name |
hCoV-19/France/IDF-220-95/2020
|
||||||||
| RNA Binding Region |
Not Specified Virus Region
|
||||||||
| Virus Name |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)
|
||||||||
| Interaction Type | Direct interaction | ||||||||
| Infection Cells | HEK293 Cells (Human embryonic kidney cell) (CVCL_0045 ) | ||||||||
| Cell Originated Tissue | Kidney | ||||||||
| Infection Time | 48 h | ||||||||
| Interaction Score | SAINT score ≥ 0.79 | ||||||||
| Method Description | comprehensive identification of RNA-binding proteins by massspectrometry (ChIRP-MS) | ||||||||
| Differential Gene Expression During SARS-COV-2 Infection | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Phosphorylation after Virus Infection | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
S112
[4] |
 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
S212
[5] |
 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
S212
[4] |
 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
S230
[5] |
 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
S374
[4] |
 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
S376
[4] |
 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
S572
[4] |
 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
S629
[4] |
 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
S652
[5] |
 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
S652
[4] |
 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
T220
[4] |
 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
T631
[4] |
 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
T87
[4] |
 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Y218
[4] |
 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Sequence Information |
MEEKPGQPQPQHHHSHHHPHHHPQQQQQQPHHHHHYYFYNHSHNHHHHHHHQQPHQYLQHGAEGSPKAQPKPLKHEQKHTLQQHQETPKKKTGYGELNGNAGEREISLKNLSSDEATNPISRVLNGNQQVVDTSLKQTVKANTFGKAGIKTKNFIQKNSMDKKNGKSYENKSGENQSVDKSDTIPIPNGVVTNNSGYITNGYMGKGADNDGSGSESGYTTPKKRKARRNSAKGCENLNIVQDKIMQQETSVPTLKQGLETFKPDYSEQKGNRVDGSKPIWKYETGPGGTSRGKPAVGDMLRKSSDSKPGVSSKKFDDRPKGKHASAVASKEDSWTLFKPPPVFPVDNSSAKIVPKISYASKVKENLNKTIQNSSVSPTSSSSSSSSTGETQTQSSSRLSQVPMSALKSVTSANFSNGPVLAGTDGNVYPPGGQPLLTTAANTLTPISSGTDSVLQDMSLTSAAVEQIKTSLFIYPSNMQTMLLSTAQVDLPSQTDQQNLGDIFQNQWGLSFINEPSAGPETVTGKSSEHKVMEVTFQGEYPATLVSQGAEIIPSGTEHPVFPKAYELEKRTSPQVLGSILKSGTTSESGALSLEPSHIGDLQKADTSSQGALVFLSKDYEIESQNPLASPTNTLLGSAKEQRYQRGLERNDSWGSFDLRAAIVYHTKEMESIWNLQKQDPKRIITYNEAMDSPDQ
Click to Show/Hide
|
|---|