Details of Host Protein
Host Protein General Information (ID: PT0133) | |||||||||
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Protein Name |
7SK snRNA methylphosphate capping enzyme (MePCE)
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Gene Name |
MEPCE
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Host Species |
Homo sapiens
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Uniprot Entry Name |
MEPCE_HUMAN
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Protein Families |
Methyltransferase superfamily
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EC Number |
2.1.1.-
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Subcellular Location |
Nucleus
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External Link | |||||||||
NCBI Gene ID | |||||||||
Uniprot ID | |||||||||
Ensembl ID | |||||||||
HGNC ID | |||||||||
Function in Host |
S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase that addsa methylphosphate cap at the 5'-end of 7SK snRNA (7SK RNA), leading tostabilize it. Alsohas a non-enzymatic function as part of the 7SK RNP complex: the 7SKRNP complex sequesters the positive transcription elongation factor b (P-TEFb) in a large inactive 7SK RNP complex preventing RNA polymeraseII phosphorylation and subsequent transcriptional elongation. The 7SK RNP complex also promotes snRNA genetranscription by RNA polymerase II via interaction with the littleelongation complex (LEC). In the 7SK RNP complex, MEPCE is required to stabilize 7SK RNA and facilitate the assembly of7SK RNP complex. MEPCE has a non-enzymatic functionin the 7SK RNP complex; interaction with LARP7 within the 7SK RNPcomplex occluding its catalytic center.
[1-4]
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3D Structure |
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Full List of Virus RNA Interacting with This Protien | |||||||||
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RNA Region: ORF10 (hCoV-19/Not Specified Virus Strain ) | |||||||||
RNA Region Details |
RNA Info
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Strains Name |
hCoV-19/Not Specified Virus Strain
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RNA Binding Region |
ORF10
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Virus Name |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)
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Infection Cells | Huh7 cells (human liver cell line) (CVCL_0336 ) | ||||||||
Cell Originated Tissue | Liver | ||||||||
Interaction Score | P-value < 0.05 | ||||||||
Method Description | RNA pull-down assays; liquid chromatography with tandem mass spectrometry (LC-MS/MS); Wilcoxon test; MS2 affinity purification coupled with liquid chromatography-mass spectrometry (MAMS) |
Differential Gene Expression During SARS-COV-2 Infection | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Protein Phosphorylation after Virus Infection | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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S152
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S152
[7] |
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S217
[7] |
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S254
[6] |
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S254
[7] |
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S330
[7] |
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S334
[7] |
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S344
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S57
[7] |
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S60
[7] |
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S69
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T213
[7] |
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T291
[6] |
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T291
[7] |
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Protein Sequence Information |
MIEMAAEKEPFLVPAPPPPLKDESGGGGGPTVPPHQEAASGELRGGTERGPGRCAPSAGSPAAAVGRESPGAAATSSSGPQAQQHRGGGPQAQSHGEARLSDPPGRAAPPDVGEERRGGGGTELGPPAPPRPRNGYQPHRPPGGGGGKRRNSCNVGGGGGGFKHPAFKRRRRVNSDCDSVLPSNFLLGGNIFDPLNLNSLLDEEVSRTLNAETPKSSPLPAKGRDPVEILIPKDITDPLSLNTCTDEGHVVLASPLKTGRKRHRHRGQHHQQQQAAGGSESHPVPPTAPLTPLLHGEGASQQPRHRGQNRDAPQPYELNTAINCRDEVVSPLPSALQGPSGSLSAPPAASVISAPPSSSSRHRKRRRTSSKSEAGARGGGQGSKEKGRGSWGGRHHHHHPLPAAGFKKQQRKFQYGNYCKYYGYRNPSCEDGRLRVLKPEWFRGRDVLDLGCNVGHLTLSIACKWGPSRMVGLDIDSRLIHSARQNIRHYLSEELRLPPQTLEGDPGAEGEEGTTTVRKRSCFPASLTASRGPIAAPQVPLDGADTSVFPNNVVFVTGNYVLDRDDLVEAQTPEYDVVLCLSLTKWVHLNWGDEGLKRMFRRIYRHLRPGGILVLEPQPWSSYGKRKTLTETIYKNYYRIQLKPEQFSSYLTSPDVGFSSYELVATPHNTSKGFQRPVYLFHKARSPSH
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