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ManualDetails of Host Protein
| Host Protein General Information (ID: PT0213) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Protein Name |
DEAD box protein 50 (DDX50)
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Gene Name |
DDX50
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| Host Species |
Homo sapiens
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Uniprot Entry Name |
DDX50_HUMAN
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| Protein Families |
DEAD box helicase family
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| EC Number |
3.6.4.13
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| Subcellular Location |
Nucleus; nucleolus
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| External Link | |||||||||
| NCBI Gene ID | |||||||||
| Uniprot ID | |||||||||
| Ensembl ID | |||||||||
| HGNC ID | |||||||||
| 3D Structure |
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| Full List of Virus RNA Interacting with This Protien | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RNA Region: ORF10 (hCoV-19/Not Specified Virus Strain ) | |||||||||
| RNA Region Details |
RNA Info
Click to show the detail information of this RNA binding region
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[1] | |||||||
| Strains Name |
hCoV-19/Not Specified Virus Strain
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| RNA Binding Region |
ORF10
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| Virus Name |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)
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| Infection Cells | Calu-3 cells (Human Lung Cancer Cell) (CVCL_0609 ) | ||||||||
| Cell Originated Tissue | Liver | ||||||||
| Interaction Score | P-value < 0.05 | ||||||||
| Method Description | RNA pull-down assays; liquid chromatography with tandem mass spectrometry (LC-MS/MS); Wilcoxon test; MS2 affinity purification coupled with liquid chromatography-mass spectrometry (MAMS) | ||||||||
| Differential Gene Expression During SARS-COV-2 Infection | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Protein Phosphorylation after Virus Infection | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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|
S113
[2] |
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|
S41
[2] |
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|
T116
[2] |
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| Protein Sequence Information |
MPGKLLWGDIMELEAPLEESESQKKERQKSDRRKSRHHYDSDEKSETRENGVTDDLDAPKAKKSKMKEKLNGDTEEGFNRLSDEFSKSHKSRRKDLPNGDIDEYEKKSKRVSSLDTSTHKSSDNKLEETLTREQKEGAFSNFPISEETIKLLKGRGVTYLFPIQVKTFGPVYEGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIERLQRNQETIKKSRSPKVLVLAPTRELANQVAKDFKDITRKLSVACFYGGTSYQSQINHIRNGIDILVGTPGRIKDHLQSGRLDLSKLRHVVLDEVDQMLDLGFAEQVEDIIHESYKTDSEDNPQTLLFSATCPQWVYKVAKKYMKSRYEQVDLVGKMTQKAATTVEHLAIQCHWSQRPAVIGDVLQVYSGSEGRAIIFCETKKNVTEMAMNPHIKQNAQCLHGDIAQSQREITLKGFREGSFKVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPQDVESYIHRSGRTGRAGRTGICICFYQPRERGQLRYVEQKAGITFKRVGVPSTMDLVKSKSMDAIRSLASVSYAAVDFFRPSAQRLIEEKGAVDALAAALAHISGASSFEPRSLITSDKGFVTMTLESLEEIQDVSCAWKELNRKLSSNAVSQITRMCLLKGNMGVCFDVPTTESERLQAEWHDSDWILSVPAKLPEIEEYYDGNTSSNSRQRSGWSSGRSGRSGRSGGRSGGRSGRQSRQGSRSGSRQDGRRRSGNRNRSRSGGHKRSFD
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