Home
Search 
Browse 
Download
ManualDetails of Host Protein
| Host Protein General Information (ID: PT1098) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Protein Name |
STMN1 messenger RNA (STMN1)
|
Gene Name |
STMN1
|
||||||
| Host Species |
Homo sapiens
|
Uniprot Entry Name |
STMN1_HUMAN
|
||||||
| Protein Families |
Stathmin family
|
||||||||
| Subcellular Location |
Cytoplasm; cytoskeleton
|
||||||||
| External Link | |||||||||
| NCBI Gene ID | |||||||||
| Uniprot ID | |||||||||
| Ensembl ID | |||||||||
| HGNC ID | |||||||||
| Function in Host |
Involved in the regulation of the microtubule (MT) filamentsystem by destabilizing microtubules. Prevents assembly and promotesdisassembly of microtubules. Phosphorylation at Ser-16 may be requiredfor axon formation during neurogenesis. Involved in the control of thelearned and innate fear.
Click to Show/Hide
|
||||||||
| Related KEGG Pathway | |||||||||
| MicroRNAs in cancer | hsa05206 |
Pathway Map 
|
|||||||
| MAPK signaling pathway | hsa04010 |
Pathway Map 
|
|||||||
| 3D Structure |
|
||||||||
| Full List of Virus RNA Interacting with This Protien | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RNA Region: 5'-UTR (hCoV-19/Wuhan-Hu-1/2019 ) | |||||||||
| RNA Region Details |
RNA Info
Click to show the detail information of this RNA binding region
|
[1] | |||||||
| Strains Name |
hCoV-19/Wuhan-Hu-1/2019
|
||||||||
| Strains Family |
Beta (B.1.351)
|
||||||||
| RNA Binding Region |
5'-UTR
|
||||||||
| Virus Name |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)
|
||||||||
| Infection Cells | HEK293 Cells (Human embryonic kidney cell) (CVCL_0045 ) | ||||||||
| Cell Originated Tissue | Liver | ||||||||
| Infection Time | 48 h | ||||||||
| Interaction Score | Prot score = 49 | ||||||||
| Method Description | RNA-protein interaction detection (RaPID) assay; liquid chromatography with tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) | ||||||||
| Differential Gene Expression During SARS-COV-2 Infection | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Phosphorylation after Virus Infection | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
S16
[2] |
 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
S16
[3] |
 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
S25
[2] |
 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
S25
[3] |
 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
S38
[2] |
 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
S38
[3] |
 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
S63
[3] |
 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Sequence Information |
MASSDIQVKELEKRASGQAFELILSPRSKESVPEFPLSPPKKKDLSLEEIQKKLEAAEERRKSHEAEVLKQLAEKREHEKEVLQKAIEENNNFSKMAEEKLTHKMEANKENREAQMAAKLERLREKDKHIEEVRKNKESKDPADETEAD
Click to Show/Hide
|
|---|