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ManualDetails of Host Protein
| Host Protein General Information (ID: PT1171) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Protein Name |
Treslin (TICRR)
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Gene Name |
TICRR
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| Host Species |
Homo sapiens
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Uniprot Entry Name |
TICRR_HUMAN
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| Protein Families |
Treslin family
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| Subcellular Location |
Nucleus
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| External Link | |||||||||
| NCBI Gene ID | |||||||||
| Uniprot ID | |||||||||
| Ensembl ID | |||||||||
| HGNC ID | |||||||||
| Function in Host |
Regulator of DNA replication and S/M and G2/M checkpoints. Regulates the triggering of DNA replication initiation via itsinteraction with TOPBP1 by participating in CDK2-mediated loading ofCDC45L onto replication origins. Required for the transition from pre-replication complex (pre-RC) to pre-initiation complex (pre-IC). Required to prevent mitotic entry after treatment with ionizingradiation.
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| 3D Structure |
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| Function of This Protein During Virus Infection | |||||||||
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| Virus Name | SARS-COV-2 | Protein Function | Pro-viral | [2] | |||||
| Infected Tissue | Lung | Infection Time | 7-9 Days | ||||||
| Infected Cell | Calu-3 Cells (Human epithelial cell line) | Cellosaurus ID | CVCL_0609 | ||||||
| Method Description | To detect the role of host protein TICRR in viral infection, TICRR protein knockout Calu-3 Cells were infected with SARS-COV-2 for 7 - 9 Days , and the effects on infection was detected through CRISPR-based genome-wide gene-knockout screen. | ||||||||
| Results | It is reported that knockout of TICRR leads to the decreased SARS-CoV-2 RNA levels compared with control group. | ||||||||
| Full List of Virus RNA Interacting with This Protien | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RNA Region: 3'-UTR (hCoV-19/Wuhan-Hu-1/2019 ) | |||||||||
| RNA Region Details |
RNA Info
Click to show the detail information of this RNA binding region
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| Strains Name |
hCoV-19/Wuhan-Hu-1/2019
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| Strains Family |
Beta (B.1.351)
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| RNA Binding Region |
3'-UTR
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| Virus Name |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)
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| Infection Cells | HEK293 Cells (Human embryonic kidney cell) (CVCL_0045 ) | ||||||||
| Cell Originated Tissue | Liver | ||||||||
| Infection Time | 48 h | ||||||||
| Interaction Score | Prot score = 29 | ||||||||
| Method Description | RNA-protein interaction detection (RaPID) assay; liquid chromatography with tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) | ||||||||
| Differential Gene Expression During SARS-COV-2 Infection | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Protein Phosphorylation after Virus Infection | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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S1026
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S1045
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S1057
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S1314
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S1334
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S1453
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S1623
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S1632
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S1728
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S1850
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S292
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S599
[4] |
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S820
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S865
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S923
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S925
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S938
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T1024
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T1134
[4] |
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T1260
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T1633
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T1848
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T969
[4] |
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Y1103
[4] |
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| Protein Sequence Information |
MACCHKVMLLLDTAGGAARHSRVRRAALRLLTYLSCRFGLARVHWAFKFFDSQGARSRPSRVSDFRELGSRSWEDFEEELEARLEDRAHLPGPAPRATHTHGALMETLLDYQWDRPEITSPTKPILRSSGRRLLDVESEAKEAEAALGGLVNAVFLLAPCPHSQRELLQFVSGCEAQAQRLPPTPKQVMEKLLPKRVREVMVARKITFYWVDTTEWSKLWESPDHLGYWTVCELLHHGGGTVLPSESFSWDFAQAGEMLLRSGIKLSSEPHLSPWISMLPTDATLNRLLYNSPEYEASFPRMEGMLFLPVEAGKEIQETWTVTLEPLAMHQRHFQKPVRIFLKGSVAQWSLPTSSTLGTDSWMLGSPEESTATQRLLFQQLVSRLTAEELHLVADVDPGEGRPPITGVISPLSASAMILTVCRTKEAEFQRHVLQTAVADSPRDTASLFSDVVDSILNQTHDSLADTASAASPVPEWAQQELGHTTPWSPAVVEKWFPFCNISGASSDLMESFGLLQAASANKEESSKTEGELIHCLAELYQRKSREESTIAHQEDSKKKRGVPRTPVRQKMNTMCRSLKMLNVARLNVKAQKLHPDGSPDVAGEKGIQKIPSGRTVDKLEDRGRTLRSSKPKDFKTEEELLSYIRENYQKTVATGEIMLYACARNMISTVKMFLKSKGTKELEVNCLNQVKSSLLKTSKSLRQNLGKKLDKEDKVRECQLQVFLRLEMCLQCPSINESTDDMEQVVEEVTDLLRMVCLTEDSAYLAEFLEEILRLYIDSIPKTLGNLYNSLGFVIPQKLAGVLPTDFFSDDSMTQENKSPLLSVPFLSSARRSVSGSPESDELQELRTRSAKKRRKNALIRHKSIAEVSQNLRQIEIPKVSKRATKKENSHPAPQQPSQPVKDTVQEVTKVRRNLFNQELLSPSKRSLKRGLPRSHSVSAVDGLEDKLDNFKKNKGYHKLLTKSVAETPVHKQISKRLLHRQIKGRSSDPGPDIGVVEESPEKGDEISLRRSPRIKQLSFSRTHSASFYSVSQPKSRSVQRVHSFQQDKSDQRENSPVQSIRSPKSLLFGAMSEMISPSEKGSARMKKRSRNTLDSEVPAAYQTPKKSHQKSLSFSKTTPRRISHTPQTPLYTPERLQKSPAKMTPTKQAAFKESLKDSSSPGHDSPLDSKITPQKRHTQAGEGTSLETKTPRTPKRQGTQPPGFLPNCTWPHSVNSSPESPSCPAPPTSSTAQPRRECLTPIRDPLRTPPRAAAFMGTPQNQTHQQPHVLRAARAEEPAQKLKDKAIKTPKRPGNSTVTSSPPVTPKKLFTSPLCDVSKKSPFRKSKIECPSPGELDQKEPQMSPSVAASLSCPVPSTPPELSQRATLDTVPPPPPSKVGKRCRKTSDPRRSIVECQPDASATPGVGTADSPAAPTDSRDDQKGLSLSPQSPPERRGYPGPGLRSDWHASSPLLITSDTEHVTLLSEAEHHGIGDLKSNVLSVEEGEGLRTADAEKSSLSHPGIPPSPPSCGPGSPLMPSRDVHCTTDGRQCQASAQLDNLPASAWHSTDSASPQTYEVELEMQASGLPKLRIKKIDPSSSLEAEPLSKEESSLGEESFLPALSMPRASRSLSKPEPTYVSPPCPRLSHSTPGKSRGQTYICQACTPTHGPSSTPSPFQTDGVPWTPSPKHSGKTTPDIIKDWPRRKRAVGCGAGSSSGRGEVGADLPGSLSLLESEGKDHGLELSIHRTPILEDFELEGVCQLPDQSPPRNSMPKAEEASSWGQFGLSSRKRVLLAKEEADRGAKRICDLREDSEVSKSKEGSPSWSAWQLPSTGDEEVFVSGSTPPPSCAVRSCLSASALQALTQSPLLFQGKTPSSQSKDPRDEDVDVLPSTVEDSPFSRAFSRRRPISRTYTRKKLMGTWLEDL
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