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ManualDetails of Host Protein
| Host Protein General Information (ID: PT1268) | |||||||||
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| Protein Name |
Nuclear protein NHN1 (ZC3H18)
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Gene Name |
ZC3H18
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| Host Species |
Homo sapiens
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Uniprot Entry Name |
ZCH18_HUMAN
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| Subcellular Location |
Nucleus
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| External Link | |||||||||
| NCBI Gene ID | |||||||||
| Uniprot ID | |||||||||
| Ensembl ID | |||||||||
| HGNC ID | |||||||||
| 3D Structure |
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| Function of This Protein During Virus Infection | |||||||||
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| Virus Name | SARS-COV-2 | Protein Function | Pro-viral | [1] | |||||
| Infected Tissue | Lung | Infection Time | 36 h | ||||||
| Infected Cell | A549 Cells (Adenocarcinomic Human alveolar basal epithelial cell) | Cellosaurus ID | CVCL_H249 | ||||||
| Method Description | To detect the role of host protein ZC3H18 in viral infection, ZC3H18 protein knockout A549 Cells were infected with SARS-COV-2 for 36 h , and the effects on infection was detected through WB. | ||||||||
| Results | It is reported that knockdown of ZC3H18 leads to the decreased infection compared with control group. | ||||||||
| Full List of Virus RNA Interacting with This Protien | |||||||||
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| RNA Region: Not Specified Virus Region (hCoV-19/England/02/2020 ) | |||||||||
| RNA Region Details |
RNA Info
Click to show the detail information of this RNA binding region
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[2] | |||||||
| Strains Name |
hCoV-19/England/02/2020
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| Strains Family |
Beta (B.1.351)
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| RNA Binding Region |
Not Specified Virus Region
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| Virus Name |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)
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| Infection Cells | Calu-3 cells (Human lung cancer cell) (CVCL_0609 ) | ||||||||
| Cell Originated Tissue | Lung | ||||||||
| Infection Time | 24 h | ||||||||
| Interaction Score | P-adjust = 0.012 | ||||||||
| Method Description | UV protein-RNA crosslinking; RNA interactome capture (cRIC); RNA antisense purification coupled with mass spectrometry (RAP-MS) | ||||||||
| Differential Gene Expression During SARS-COV-2 Infection | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Protein Phosphorylation after Virus Infection | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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S118
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S46
[3] |
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S487
[3] |
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S534
[3] |
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S583
[3] |
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S584
[3] |
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S67
[3] |
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S74
[3] |
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S795
[3] |
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S842
[3] |
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S852
[4] |
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S852
[3] |
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S868
[4] |
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S868
[3] |
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S893
[4] |
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S893
[3] |
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T162
[3] |
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T677
[3] |
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| Protein Sequence Information |
MDVAESPERDPHSPEDEEQPQGLSDDDILRDSGSDQDLDGAGVRASDLEDEESAARGPSQEEEDNHSDEEDRASEPKSQDQDSEVNELSRGPTSSPCEEEGDEGEEDRTSDLRDEASSVTRELDEHELDYDEEVPEEPAPAVQEDEAEKAGAEDDEEKGEGTPREEGKAGVQSVGEKESLEAAKEKKKEDDDGEIDDGEIDDDDLEEGEVKDPSDRKVRPRPTCRFFMKGNCTWGMNCRFIHPGVNDKGNYSLITKADPFPPNGAPPLGPHPLMPANPWGGPVVDEILPPPPPEPPTESAWERGLRHAKEVLKKATIRKEQEPDFEEKRFTVTIGEDEREFDKENEVFRDWNSRIPRDVRDTVLEPYADPYYDYEIERFWRGGQYENFRVQYTETEPYHNYRERERERERENRQRERERERERDRERERRQRERERERERERDKERQRRKEEWERERAKRDEKDRQHRDRDREKEREKEKGKPKPRSPQPPSRQAEPPKKEAATTGPQVKRADEWKDPWRRSKSPKKKLGVSVSPSRARRRRKTSASSASASNSSRSSSRSSSYSGSGSSRSRSRSSSYSSYSSRSSRHSSFSGSRSRSRSFSSSPSPSPTPSPHRPSIRTKGEPAPPPGKAGEKSVKKPAPPPAPPQATKTTAPVPEPTKPGDPREARRKERPARTPPRRRTLSGSGSGSGSSYSGSSSRSRSLSVSSVSSVSSATSSSSSAHSVDSEDMYADLASPVSSASSRSPAPAQTRKEKGKSKKEDGVKEEKRKRDSSTQPPKSAKPPAGGKSSQQPSTPQQAPPGQPQQGTFVAHKEIKLTLLNKAADKGSRKRYEPSDKDRQSPPPAKRPNTSPDRGSRDRKSGGRLGSPKPERQRGQNSKAPAAPADRKRQLSPQSKSSSKVTSVPGKASDPGAASTKSGKASTLSRREELLKQLKAVEDAIARKRAKIPGKA
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