Details of Host Protein
Host Protein General Information (ID: PT0191) | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Protein Name |
Apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus (Acinus)
|
Gene Name |
ACIN1
|
||||||
Host Species |
Homo sapiens
|
Uniprot Entry Name |
ACINU_HUMAN
|
||||||
Subcellular Location |
Nucleus
|
||||||||
External Link | |||||||||
NCBI Gene ID | |||||||||
Uniprot ID | |||||||||
Ensembl ID | |||||||||
HGNC ID | |||||||||
Function in Host |
Auxiliary component of the splicing-dependent multiproteinexon junction complex (EJC) deposited at splice junction on mRNAs. TheEJC is a dynamic structure consisting of core proteins and severalperipheral nuclear and cytoplasmic associated factors that join thecomplex only transiently either during EJC assembly or duringsubsequent mRNA metabolism. Component of the ASAP complexes which bindRNA in a sequence-independent manner and are proposed to be recruitedto the EJC prior to or during the splicing process and to regulatespecific excision of introns in specific transcription subsets; ACIN1confers RNA-binding to the complex. The ASAP complex can inhibit RNAprocessing during in vitro splicing reactions. The ASAP complexpromotes apoptosis and is disassembled after induction of apoptosis. Involved in the splicing modulation of BCL2L1/Bcl-X (and probably otherapoptotic genes); specifically inhibits formation of proapoptoticisoforms such as Bcl-X (S); the activity is different from theestablished EJC assembly and function. Induces apoptotic chromatincondensation after activation by CASP3. Regulates cyclin A1, but notcyclin A2, expression in leukemia cells.
[1-5]
Click to Show/Hide
|
||||||||
Related KEGG Pathway | |||||||||
Nucleocytoplasmic transport | hsa03013 | Pathway Map | |||||||
mRNA surveillance pathway | hsa03015 | Pathway Map | |||||||
Spliceosome | hsa03040 | Pathway Map | |||||||
3D Structure |
|
Host Protein - Virus RNA Network | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Full List of Virus RNA Interacting with This Protien | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RNA Region: Not Specified Virus Region (hCoV-19/Not Specified Virus Strain ) | |||||||||
RNA Region Details | RNA Info Click to show the detail information of this RNA binding region | [6] | |||||||
Strains Name |
hCoV-19/Not Specified Virus Strain
|
||||||||
RNA Binding Region |
Not Specified Virus Region
|
||||||||
Virus Name |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)
|
||||||||
Infection Cells | Huh7 cells (liver carcinoma cell) (CVCL_0336 ) | ||||||||
Cell Originated Tissue | Liver | ||||||||
Infection Time | 24h | ||||||||
Interaction Score | log2FC = 4.64093E+14 | ||||||||
Method Description | RNA antisense purification and quantitative mass spectrometry (RAP-MS); Tandem mass tag (TMT) labelling; liquid chromatography tandem mass spectrometry (LC-MS/MS); Westernblot | ||||||||
RNA Region: Not Specified Virus Region (hCoV-19/England/02/2020 ) | |||||||||
RNA Region Details | RNA Info Click to show the detail information of this RNA binding region | [7] | |||||||
Strains Name |
hCoV-19/England/02/2020
|
||||||||
Strains Family |
Beta (B.1.351)
|
||||||||
RNA Binding Region |
Not Specified Virus Region
|
||||||||
Virus Name |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)
|
||||||||
Infection Cells | Calu-3 cells (Human lung cancer cell) Calu-3 cells (Human lung cancer cell) (CVCL_0609 ) | ||||||||
Cell Originated Tissue | Lung | ||||||||
Infection Time | 24 h | ||||||||
Interaction Score | P-adjust = 0.023 | ||||||||
Method Description | UV protein-RNA crosslinking; RNA interactome capture (cRIC); RNA antisense purification coupled with mass spectrometry (RAP-MS) |
Differential Gene Expression During SARS-COV-2 Infection | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
Protein Phosphorylation after Virus Infection | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
S1004
[8] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
S1004
[9] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
S1104
[9] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
S216
[8] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
S216
[9] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
S240
[9] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
S365
[9] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
S386
[9] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
S388
[9] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
S410
[9] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
S478
[9] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
S490
[9] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
S561
[8] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
S561
[9] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
S655
[9] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
S657
[8] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
S657
[9] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
S710
[8] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
S710
[9] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
S729
[9] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
S825
[9] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
S838
[8] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
S838
[9] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
S895
[9] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
S898
[9] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
T408
[9] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
T470
[9] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
T563
[9] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
T682
[9] |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
T840
[9] |
Protein Sequence Information |
MWRRKHPRTSGGTRGVLSGNRGVEYGSGRGHLGTFEGRWRKLPKMPEAVGTDPSTSRKMAELEEVTLDGKPLQALRVTDLKAALEQRGLAKSGQKSALVKRLKGALMLENLQKHSTPHAAFQPNSQIGEEMSQNSFIKQYLEKQQELLRQRLEREAREAAELEEASAESEDEMIHPEGVASLLPPDFQSSLERPELELSRHSPRKSSSISEEKGDSDDEKPRKGERRSSRVRQARAAKLSEGSQPAEEEEDQETPSRNLRVRADRNLKTEEEEEEEEEEEEDDEEEEGDDEGQKSREAPILKEFKEEGEEIPRVKPEEMMDERPKTRSQEQEVLERGGRFTRSQEEARKSHLARQQQEKEMKTTSPLEEEEREIKSSQGLKEKSKSPSPPRLTEDRKKASLVALPEQTASEEETPPPLLTKEASSPPPHPQLHSEEEIEPMEGPAPAVLIQLSPPNTDADTRELLVSQHTVQLVGGLSPLSSPSDTKAESPAEKVPEESVLPLVQKSTLADYSAQKDLEPESDRSAQPLPLKIEELALAKGITEECLKQPSLEQKEGRRASHTLLPSHRLKQSADSSSSRSSSSSSSSSRSRSRSPDSSGSRSHSPLRSKQRDVAQARTHANPRGRPKMGSRSTSESRSRSRSRSRSASSNSRKSLSPGVSRDSSTSYTETKDPSSGQEVATPPVPQLQVCEPKERTSTSSSSVQARRLSQPESAEKHVTQRLQPERGSPKKCEAEEAEPPAATQPQTSETQTSHLPESERIHHTVEEKEEVTMDTSENRPENDVPEPPMPIADQVSNDDRPEGSVEDEEKKESSLPKSFKRKISVVSATKGVPAGNSDTEGGQPGRKRRWGASTATTQKKPSISITTESLKSLIPDIKPLAGQEAVVDLHADDSRISEDETERNGDDGTHDKGLKICRTVTQVVPAEGQENGQREEEEEEKEPEAEPPVPPQVSVEVALPPPAEHEVKKVTLGDTLTRRSISQQKSGVSITIDDPVRTAQVPSPPRGKISNIVHISNLVRPFTLGQLKELLGRTGTLVEEAFWIDKIKSHCFVTYSTVEEAVATRTALHGVKWPQSNPKFLCADYAEQDELDYHRGLLVDRPSETKTEEQGIPRPLHPPPPPPVQPPQHPRAEQREQERAVREQWAEREREMERRERTRSEREWDRDKVREGPRSRSRSRDRRRKERAKSKEKKSEKKEKAQEEPPAKLLDDLFRKTKAAPCIYWLPLTDSQIVQKEAERAERAKEREKRRKEQEEEEQKEREKEAERERNRQLEREKRREHSRERDRERERERERDRGDRDRDRERDRERGRERDRRDTKRHSRSRSRSTPVRDRGGRR
Click to Show/Hide
|
---|