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ManualDetails of Host Protein
| Host Protein General Information (ID: PT0968) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Protein Name |
RNA-binding protein 14 (IGKV1-33)
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Gene Name |
RBM14
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| Host Species |
Homo sapiens
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Uniprot Entry Name |
RBM14_HUMAN
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| Subcellular Location |
Nucleus; nucleolus Cytoplasm
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| External Link | |||||||||
| NCBI Gene ID | |||||||||
| Uniprot ID | |||||||||
| Ensembl ID | |||||||||
| HGNC ID | |||||||||
| Function in Host |
Isoform 1 may function as a nuclear receptor coactivator, enhancing transcription through other coactivators such as NCOA6 andCITED1. Isoform 2, functions as a transcriptional repressor, modulatingtranscriptional activities of coactivators including isoform 1, NCOA6and CITED1. Regulates centriole biogenesis bysuppressing the formation of aberrant centriolar protein complexes inthe cytoplasm and thus preserving mitotic spindle integrity. Preventsthe formation of the STIL-CENPJ complex (which can induce the formationof aberrant centriolar protein complexes) by interfering with theinteraction of STIL with CENPJ. Plays a role in theregulation of DNA virus-mediated innate immune response by assemblinginto the HDP-RNP complex, a complex that serves as a platform for IRF3phosphorylation and subsequent innate immune response activationthrough the cGAS-STING pathway.
[1-3]
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| 3D Structure |
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| Host Protein - Virus RNA Network | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Full List of Virus RNA Interacting with This Protien | |||||||||
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| RNA Region: ORF10 (hCoV-19/Not Specified Virus Strain ) | |||||||||
| RNA Region Details |
RNA Info
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| Strains Name |
hCoV-19/Not Specified Virus Strain
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| RNA Binding Region |
ORF10
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| Virus Name |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)
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| Infection Cells | Huh7 cells (human liver cell line) (CVCL_0336 ) | ||||||||
| Cell Originated Tissue | Liver | ||||||||
| Interaction Score | P-value < 0.05 | ||||||||
| Method Description | RNA pull-down assays; liquid chromatography with tandem mass spectrometry (LC-MS/MS); Wilcoxon test; MS2 affinity purification coupled with liquid chromatography-mass spectrometry (MAMS) | ||||||||
| RNA Region: Not Specified Virus Region (hCoV-19/USA/WA1/2020 ) | |||||||||
| RNA Region Details |
RNA Info
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[5] | |||||||
| Strains Name |
hCoV-19/USA/WA1/2020
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| Strains Family |
Alpha (B.1.1.7)
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| RNA Binding Region |
Not Specified Virus Region
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| Virus Name |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)
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| Infection Cells | Huh7.5 cells (Hepatocyte derived cellular carcinoma cell) Huh7.5 cells (Hepatocyte derived cellular carcinoma cell) (CVCL_7927 ) | ||||||||
| Cell Originated Tissue | Liver | ||||||||
| Infection Time | 48 h | ||||||||
| Interaction Score | FDR ≤ 0.05 | ||||||||
| Method Description | comprehensive identification of RNA-binding proteins by massspectrometry (ChIRP-MS) | ||||||||
| RNA Region: Not Specified Virus Region (hCoV-19/France/IDF-220-95/2020 ) | |||||||||
| RNA Region Details |
RNA Info
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[6] | |||||||
| Strains Name |
hCoV-19/France/IDF-220-95/2020
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| RNA Binding Region |
Not Specified Virus Region
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| Virus Name |
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)
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| Interaction Type | Direct interaction | ||||||||
| Infection Cells | HEK293 Cells (Human embryonic kidney cell) HEK293 Cells (Human embryonic kidney cell) (CVCL_0045 ) | ||||||||
| Cell Originated Tissue | Kidney | ||||||||
| Infection Time | 48 h | ||||||||
| Interaction Score | SAINT score ≥ 0.79 | ||||||||
| Method Description | comprehensive identification of RNA-binding proteins by massspectrometry (ChIRP-MS) | ||||||||
| Differential Gene Expression During SARS-COV-2 Infection | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Protein Phosphorylation after Virus Infection | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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S215
[7] |
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S244
[7] |
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S254
[7] |
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S256
[7] |
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S278
[7] |
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S280
[7] |
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S521
[7] |
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S523
[7] |
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S582
[7] |
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S618
[7] |
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S623
[7] |
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S649
[7] |
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T206
[7] |
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T572
[7] |
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Y558
[7] |
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| Protein Sequence Information |
MKIFVGNVDGADTTPEELAALFAPYGTVMSCAVMKQFAFVHMRENAGALRAIEALHGHELRPGRALVVEMSRPRPLNTWKIFVGNVSAACTSQELRSLFERRGRVIECDVVKDYAFVHMEKEADAKAAIAQLNGKEVKGKRINVELSTKGQKKGPGLAVQSGDKTKKPGAGDTAFPGTGGFSATFDYQQAFGNSTGGFDGQARQPTPPFFGRDRSPLRRSPPRASYVAPLTAQPATYRAQPSVSLGAAYRAQPSASLGVGYRTQPMTAQAASYRAQPSVSLGAPYRGQLASPSSQSAAASSLGPYGGAQPSASALSSYGGQAAAASSLNSYGAQGSSLASYGNQPSSYGAQAASSYGVRAAASSYNTQGAASSLGSYGAQAASYGAQSAASSLAYGAQAASYNAQPSASYNAQSAPYAAQQAASYSSQPAAYVAQPATAAAYASQPAAYAAQATTPMAGSYGAQPVVQTQLNSYGAQASMGLSGSYGAQSAAAATGSYGAAAAYGAQPSATLAAPYRTQSSASLAASYAAQQHPQAAASYRGQPGNAYDGAGQPSAAYLSMSQGAVANANSTPPPYERTRLSPPRASYDDPYKKAVAMSKRYGSDRRLAELSDYRRLSESQLSFRRSPTKSSLDYRRLPDAHSDYARYSGSYNDYLRAAQMHSGYQRRM
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